In Godzilla: City on the Edge of Battle werden wir sehen, wie Menschen versuchen, den Planeten Erde von dem bösen Monster Godzilla zu befreien, das sich so weit entwickelt hat, dass das gesamte Ökosystem der Erde mit ihm verschmolzen ist. Glücklicherweise sind die Überreste von Mechagodzilla immer noch auf der Erde aktiv, was die Waage zugunsten der Menschen ausgleichen könnte.
Die Seatopianer haben genug von den Atomtests an der Erdoberfläche und lassen ein Käfermonster los, um sich zu rächen. Ein menschlicher Wissenschaftler beschließt jedoch, mit seinem Roboter Jet Jaguar zu versuchen, das Monster zu eliminieren. Gozdilla und Gigan werden sich diesem Kampf anschließen.
Der böse Dr. Who hat einen riesigen Roboter erschaffen, um ein mächtiges Material aus dem Nordpol zu extrahieren. Leider bricht der Roboter zusammen und der Wissenschaftler beschließt, King Kong zu entführen, um die Aufgabe zu erfüllen, was dazu führt, dass er erneut auf einen alten Feind trifft.