En Godzilla: City on the Edge of Battle veremos como los humanos tratan de recuperar el planeta Tierra del malvado monstruo Godzilla, que ha evolucionado hasta tal punto, que todo el ecosistema terrestre se ha mimetizado con él. Afortunadamente los restos de Mechagodzilla todavía están activos en la Tierra, lo cual puede equilibrar la balanza a favor de los humanos.
Un naufragio cerca de una isla desalojada por la radiación descubre que quedan seres humanos viviendo en ella. Un grupo de científicos viajará a la isla para investigarla, sin embargo algo sobrenatural cambiará el destino de todos ellos para siempre