Afin de les empêcher de tuer à nouveau, le gouvernement autorise l'implantation d'une puce dans le cerveau de criminels récidivistes, Cletus Kasady (Carnage) et The Joker étant les premiers patients. Malheureusement, les plans ne se dérouleront pas comme prévu, ce qui obligera Spider-man et Batman à faire équipe pour arrêter leurs dangereux ennemis.